As missões são divididas em dois tipos, Missões em ON e Missões em OFF, cada uma oferecendo recompensas únicas.
OFF: São missões que dão como recompensa apenas Ryous, podem ser feitas á qualquer hora, bastando pedir na área específica no Gabinete do Kage. É possível fazer no máximo duas missões em off por dia.
ON: Missões em ON que dão como recompensa Ryous, itens, armas e até mesmo corpos de ninjas. As missões em ON deverão ser pedidas diretamente ao Kage ou aos Sannin, elas são geralmente missões perigosas que envolvem riscos como invadir vilas, reuniões e escoltas de pessoas importantes
Para pedir uma missão, deve-se criar um tópico em
Pedidos, informando o rank da missão que deseja e esperar um narrador.